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第1407章 治疗的难度（第2页）

“编辑效率出来了。麦金利，肝癌细胞中靶率百分之八十七点六。老郑，百分之八十五点九。阿达玛，百分之八十六点四。”

“正常肝细胞的中靶率呢？”

“零点三以下。基本上没脱靶。”

赵一舟把脱靶分析的结果放大，屏幕上显示出全基因组范围内的脱靶位点扫描结果。

三条曲线几乎贴在x轴上，只有几个位点有微弱信号，峰高不到背景噪声的两倍。

“用全基因组测序扫了三十亿个碱基对，三个人的脱靶位点加起来不过七个，而且全在非编码区。非编码区的脱靶不会影响蛋白质功能，临床风险基本为零。”

“这几个脱靶位点是同一类型吗？”

“不是，麦金利的脱靶位点在17号染色体长臂，一个LIne-1反转录转座子的残留片段里。老郑的在8号染色体短臂，一个假基因旁边。”

“阿达玛的呢？”

“阿达玛的最有意思，脱靶位点在一个跟疟疾抗性相关的基因附近。”

“疟疾抗性？会不会影响那个基因的功能？”

“测序深度不够，暂时判断不了。但布莱恩已经让英格丽德调了非洲人群的snp数据库做比对。”

“初步结论是什么？”

“初步结论是，那个位点在塞内加尔人群里本身就是多态性的，有人带这个突变，有人不带。阿达玛恰好是带的那一个。所以编辑酶跑到那里去，可能不是因为脱靶，而是因为那个位点的序列跟sgRna的靶点有部分相似性。”

“序列相似度多少？”

“十七个碱基里有十三个匹配，按照脱靶预测模型，这个相似度理论上不应该被切割。”

“理论上不应该，但实验数据说切了。理论跟实验打架的时候，谁赢？”

“实验赢，这是上帝之手的规矩。”

陈述把脱靶位点的序列调出来，放大。屏幕上出现两行碱基序列，上面一行是sgRna的靶点，下面一行是阿达玛的脱靶位点。

两行序列的差别用红色标注，十三个匹配的碱基是绿色的，四个不匹配的是红色的。红色碱基的分布位置在序列的中间，正好是cas9核酸酶的切割活性中心对应的位置。

“看到了吗？不匹配的四个碱基不在切割核心区，cas9对核心区以外的错配有一定的容忍度，这就是为什么这个位点被切了。不是算法不行，是酶本身的特异性就不够高。”

“那怎么办？”

“下一版方案用高保真cas9变体。现在这版用的野生型cas9，特异性已经算好了，但还能更好。”

“怎么改？”

“英格丽德已经在筛新的变体了，从spcas9到sacas9到cpf1，每个变体的脱靶谱都不一样。等三个受试者的第一周期数据全部跑完，用这批数据训练一个新的脱靶预测模型，下一版方案的编辑精度还能再提升至少半个数量级。”

“你什么时候学会说‘至少半个数量级’这种话了？”

“跟安德斯学的。他说‘还行’的时候，意思是比预期好半个数量级。说‘可以接受’的时候，意思是刚好符合预期。说‘再看看’的时候，意思是差了半个数量级。”

“我跟他学了三个月，学会了用数量级说话。”

“那你现在觉得，百分之八十七的中靶率，是还行还是可以接受？”

“是还行。”

赵一舟把这个词记在实验日志里。

日志是电子版的，自动同步到课题组共享文件夹。文件夹的名字叫“肝癌三联方案_临床第一期_实时数据”，访问权限只有课题组成员和布莱恩、理查德、乔治三人。

连李晨都没有权限。

不是不信任，是规矩。临床数据的访问权限，必须严格控制在直接参与数据分析的人手里。多一个人看，多一分泄露的风险。

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